为了配合这一进程，萧如薰也做了其他的改革。
每一名士兵参军之后首先学习的就是规章制度和效忠皇帝，军校生在进入军队之前最先掌握的也是大秦军队规章制度和效忠皇帝。
士兵从应征从军背到分配到具体部队，进入军队以后还有军中文书亲自指导学习认字，还有军校生出身的基层排长班长带领大家一起学习认字。
军校生从入学背到毕业，人人都能极其流利的背诵各种军队规章制度和标准流程。
他们就像是精密仪器里的零部件一样，按照规章制度一丝不苟的生活和训练。
然后，军中法制的发展是萧如薰着重抓起的重中之重，在这一步骤之中，萧如薰极力扩大军法处的威严，将军官的这一权力基本剥夺。
在大秦军中，任何违反流程的行为和犯罪都会被上报到军中军法处，由军法处处理而不是由军队里的军事主官处理。
军队里负责执法的就是军法处，大到一个兵团小到一个连队都有各自的军法处，军队里军法处无处不在，军官没有执法权，执法的只能是军法处。
别说底下的军官，连兵团主帅对军队里有人犯法的事情也没有处置权，只有在军法处负责审理和处罚的时候旁听，没有提出意见的权利。
兵团军法处负责人直接对中央组织部军法司负责，而中央组织部是皇帝的直辖部门，连内阁都管不到。
萧如薰在秦军改组的过程中直接将一切曾经比较暧昧的军中规矩给规范化明确化了。
在他的权力已经无可撼动的情况之下，军队里的法制建设正式确立。
军官的权力被限制了，对基层士兵和下属不再拥有生杀大权，这是军队国家化最为重要的一步。
反对者——没有。
或者说不敢有。
至此，秦军基本完成近代化改革，开始成为真正的近代化国家军队。
于是一切关于高级军官拥兵自重的担忧都成为了无根浮萍，是没有依据的，兵团高级军官们对于外界的种种猜测都是报以无奈的苦笑。
担心什么？
曾经担心的事情，现在一点都不担心了，因为我们是真的没有造反的能力了。
另外，为了确保边远地区驻军的规章制度的确立，避免出现山高皇帝远的退化现象，萧如薰做了很多安排。
他不仅安排了黑水和黑鸩两条暗线在暗处监视军中军官，还增设了多种讯息传播方式，确保军队里发生任何军官试图侵夺军法处权力的事情的时候，皇帝会以最快的速度知道。
隆武五年年初曾经发生一起西北兵团的一名师主将包庇犯法的侄子然后被军法处揭露之后还试图阻止军法处执法的事情，引起了轩然大波。