尽管让哱拜、哱承恩等人逃走了，但宁夏之役仍然可以算是大获全胜。朝廷调用的兵力远比预想的要少，而战事的持续时间也大大缩短，节省下来的军费十分可观。
叶梦熊手下的书吏忙着写报功文书，对于参战各将领的功劳分配，自然是要颇费一番心思的。好在苏昊主动谦让了攻克宁夏城的功劳，萧如熏知道自己根基尚浅，能够当上宁夏总兵官已经是很不容易，因此也不再与李如松争功。这样一来，宁夏之役的首功就算到了李如松的头上，也不枉他劳师费力地跑一趟了。
首功之下，萧如熏、苏昊、马千乘分别领了次功，然后就轮到各部的中下层军官以及有突出表现的士兵。徐光启、郝青等技术人员也都名列请功名单之上，在这样的大胜利面前，估计朝廷也不会吝惜这些功名的。
按照朝廷事先的安排，收复宁夏城之后，萧如熏的宁夏总兵职位依然保留，统领宁夏诸卫兵马。他把自己原来所带的平虏所军将都普遍升了一级，让他们分; 任各卫所的千总、百总等职。至于再上一级的参将、游击将军等位置，就只能等兵部再安排人来担任了。
宁夏城里被刘东旸、哱拜裹胁参加叛乱的官兵受到了严格的甄别。有罪行的官兵被夺去军户身份，送往煤矿当苦力。普通军官被调离原来的队伍，降职甚至贬为普通士兵使用。至于原来就是士兵的，现在贬无可贬，也不宜责罚，只能继续保留使用。不过，他们头顶上的罪名还要再扛一段时间，萧如熏发下号令，说如果这些士兵在一段时间内再有什么违犯军令之类的过错，就要二罪并罚。予以严惩。
除了那些被送去挖煤的军士之外，其余参与了叛乱的官兵都有一种劫后余生的感觉。在朝廷大军兵临城下之时，他们觉得自己已经是末日来临，城破之日就是他们的断头之时。谁料想，朝廷大军顺利地攻破了城墙，却没有对他们大开杀戒。区区的降职或者警诫几乎不能算是惩罚，能够活下来就算是万幸了。
让官兵们更加觉得意外的，是萧如熏随即宣布了整个宁夏卫的福利计划。原来仅限于平虏所官兵享受的煤炭供应和蔬菜暖棚，将推广至宁夏诸卫的所有官兵。萧如熏还承诺，党馨担任宁夏巡抚期间拖欠的官兵薪饷和服装。将在未来一两年内全部补齐，而官兵的屯田税赋，也将减免两年，既往不咎。
“多谢萧总兵！”
“萧总兵仁义！”
“愿为萧总兵鞍前马后，两肋插刀！”
消息传出，宁夏卫官兵奔走相告，更有跑到总兵府门口痛哭流涕、磕头立誓之人。萧如熏让手下的中军官出去安抚那些前来表示忠心的官兵，自己坐在议事厅里，与苏昊谈起此事。也是感慨万千。
“这些原本都是他们应得的东西，若是党馨能够早点给他们这些，也不至于惹来杀身之祸了。”萧如熏说道。
苏昊道：“党馨死有余辜，可怜的是那些被逼着造反的军户。莫名其妙地被裹胁进去，送了性命。还有那些为了平定叛乱而捐躯的将士，也是无妄之灾。而这一切，全都是因为党馨一人的贪念啊。”
萧如熏道：“改之。说起此事，萧某真要特别感谢你，其实这煤矿也罢。暖棚也罢，都是拜你所赐，我宁夏卫官兵要感谢的是你才对啊。”
苏昊道：“萧大哥言重了，我做这些事不过是举手之劳。边军兄弟们戍边如此艰苦，我出这点力算得了什么？”
“大恩不言谢，改之这一次对我宁夏边军恩重如山，萧某只能日后图报了。”萧如熏说道。
“萧大哥这样说，就让小弟汗颜了。”苏昊摆摆手，揭过了这个话题，转而问道：“萧大哥，你现在是宁夏总兵了，对于未来宁夏卫的防务，可有何想法？”
萧如熏知道苏昊不是凭空发问，便道：“萧某正想听听改之的想法呢。”
苏昊也不客气，直接说道：“苏昊与萧大哥在平虏城的时候，曾与萧大哥谈起过，对于鞑靼人的威胁，进攻比防守更有效，萧大哥可记得此话。”
萧如熏点头道：“当然记得，改之的意思是……”